fcernafukuzaki commited on
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1
+ # -*- coding: utf-8 -*-
2
+ """Deploy Barcelo demo.ipynb
3
+ Automatically generated by Colaboratory.
4
+ Original file is located at
5
+ https://colab.research.google.com/drive/1FxaL8DcYgvjPrWfWruSA5hvk3J81zLY9
6
+ ![ ](https://www.vicentelopez.gov.ar/assets/images/logo-mvl.png)
7
+ # Modelo
8
+ YOLO es una familia de modelos de detección de objetos a escala compuesta entrenados en COCO dataset, e incluye una funcionalidad simple para Test Time Augmentation (TTA), model ensembling, hyperparameter evolution, and export to ONNX, CoreML and TFLite.
9
+ ## Gradio Inferencia
10
+ ![](https://i.ibb.co/982NS6m/header.png)
11
+ Este Notebook se acelera opcionalmente con un entorno de ejecución de GPU
12
+ ----------------------------------------------------------------------
13
+ YOLOv5 Gradio demo
14
+ *Author: Ultralytics LLC and Gradio*
15
+ # Código
16
+ """
17
+
18
+ #!pip install -qr https://raw.githubusercontent.com/ultralytics/yolov5/master/requirements.txt gradio # install dependencies
19
+
20
+ import os
21
+ import re
22
+ import json
23
+ import numpy as np
24
+ import pandas as pd
25
+ import gradio as gr
26
+ import torch
27
+ from PIL import Image
28
+ from ultralytics import YOLO
29
+ from ultralyticsplus import render_result
30
+
31
+ # Images
32
+ torch.hub.download_url_to_file('https://i.pinimg.com/originals/7f/5e/96/7f5e9657c08aae4bcd8bc8b0dcff720e.jpg', 'ejemplo1.jpg')
33
+ torch.hub.download_url_to_file('https://i.pinimg.com/originals/c2/ce/e0/c2cee05624d5477ffcf2d34ca77b47d1.jpg', 'ejemplo2.jpg')
34
+
35
+ # Model
36
+ class YOLODetect():
37
+ def __init__(self, modelo):
38
+ self.modelo = YOLO(modelo)
39
+
40
+ def predecir(self, url):
41
+ # conf float 0.25 umbral de confianza del objeto para la detección
42
+ # iou float 0.7 umbral de intersección sobre unión (IoU) para NMS
43
+ self.source = url
44
+ self.results = self.modelo.predict(source=self.source, imgsz=640, conf=0.5, iou=0.40)
45
+ return self.results
46
+
47
+ def show(self):
48
+ render = render_result(model=self.modelo, image=self.source, result=self.results[0])
49
+ return render
50
+
51
+ def to_json(self):
52
+ array_numpy = self.results[0].boxes.cls.cpu().numpy().astype(np.int32)
53
+ # Definir las clases y sus nombres correspondientes
54
+ clases = {
55
+ 0: "Aedes",
56
+ 1: "Mosquitos",
57
+ 2: "Moscas"
58
+ }
59
+
60
+ # Contabilizar las clases
61
+ conteo_clases = np.bincount(array_numpy)
62
+
63
+ self.json_result = [{'Especie': clases[i], 'Cantidad': conteo_clases[i] if i < len(conteo_clases) else 0} for i in range(len(clases))]
64
+ return self.json_result
65
+
66
+ def to_dataframe(self):
67
+ return pd.DataFrame(self.json_result)
68
+
69
+ modelo_yolo = YOLO('best.pt')
70
+ #HF_TOKEN = os.getenv("ZIKA_TOKEN_WRITE")
71
+ #hf_writer = gr.HuggingFaceDatasetSaver(HF_TOKEN, "demo-iazika-flags")
72
+
73
+ # def getQuantity(string):
74
+ # contador_raw = ''.join(string.split(" ")[3:])
75
+
76
+ # resultado_especie_1 = 'Aedes'
77
+ # resultado_especie_2 = 'Mosquito'
78
+ # resultado_especie_3 = 'Mosca'
79
+ # resultado_cantidad_1 = ''.join(re.findall(r'\d+',''.join(re.findall(r'\d+'+resultado_especie_1, contador_raw))))
80
+ # resultado_cantidad_2 = ''.join(re.findall(r'\d+',''.join(re.findall(r'\d+'+resultado_especie_2, contador_raw))))
81
+ # resultado_cantidad_3 = ''.join(re.findall(r'\d+',''.join(re.findall(r'\d+'+resultado_especie_3, contador_raw))))
82
+ # resultado_cantidad_1 = resultado_cantidad_1 if len(resultado_cantidad_1) > 0 else "0"
83
+ # resultado_cantidad_2 = resultado_cantidad_2 if len(resultado_cantidad_2) > 0 else "0"
84
+ # resultado_cantidad_3 = resultado_cantidad_3 if len(resultado_cantidad_3) > 0 else "0"
85
+
86
+ # resultado_lista = [[resultado_cantidad_1,resultado_especie_1],
87
+ # [resultado_cantidad_2,resultado_especie_2],
88
+ # [resultado_cantidad_3,resultado_especie_3]]
89
+
90
+ # return resultado_lista
91
+
92
+ # def listJSON(resultado):
93
+ # resultado_lista = getQuantity(resultado)
94
+ # img_name = " ".join(resultado.split(" ")[0:2])
95
+ # img_size = "".join(resultado.split(" ")[2])
96
+ # strlista = ""
97
+ # for resultado_lista, description in resultado_lista:
98
+ # strlista += '{"quantity":"'+resultado_lista+'","description":"'+description+'"},'
99
+ # strlista = strlista[:-1]
100
+ # str_resultado_lista = '{"image":"'+str(img_name)+'","size":"'+str(img_size)+'","detail":['+strlista+']}'
101
+ # json_string = json.loads(str_resultado_lista)
102
+ # return json_string
103
+
104
+ # def arrayLista(resultado):
105
+ # resultado_lista = getQuantity(resultado)
106
+ # df = pd.DataFrame(resultado_lista,columns=['Cantidad','Especie'])
107
+ # return df
108
+
109
+ def yolo(size, iou, conf, im):
110
+ '''Wrapper fn for gradio'''
111
+ g = (int(size) / max(im.size)) # gain
112
+ im = im.resize((int(x * g) for x in im.size), Image.LANCZOS) # resize with antialiasing
113
+
114
+
115
+ # model.iou = iou
116
+
117
+ # model.conf = conf
118
+
119
+
120
+ # results2 = model(im) # inference
121
+ # #print(type(results2))
122
+
123
+ source = Image.open(im)
124
+ model = YOLODetect(modelo_yolo)
125
+ # perform inference
126
+ results = model.predecir(source)
127
+
128
+ result_json = model.to_json()
129
+ print(result_json)
130
+ result_df = model.to_dataframe()
131
+ print(result_df)
132
+ result_img = model.show()
133
+
134
+ # results2.render() # updates results.imgs with boxes and labels
135
+
136
+ # results_detail = str(results2)
137
+ # lista = listJSON(results_detail)
138
+ # lista2 = arrayLista(results_detail)
139
+ # return Image.fromarray(results2.ims[0]), lista2, lista
140
+ return result_img, result_df, result_json
141
+
142
+ #------------ Interface-------------
143
+
144
+
145
+
146
+ in1 = gr.Radio(['640', '1280'], label="Tamaño de la imagen", type='value')
147
+ in2 = gr.Slider(minimum=0, maximum=1, step=0.05, label='NMS IoU threshold')
148
+ in3 = gr.Slider(minimum=0, maximum=1, step=0.05, label='Umbral o threshold')
149
+ in4 = gr.Image(type='pil', label="Original Image")
150
+
151
+ out2 = gr.Image(type="pil", label="YOLOv5")
152
+ out3 = gr.Dataframe(label="Cantidad_especie", headers=['Cantidad','Especie'], type="pandas")
153
+ out4 = gr.JSON(label="JSON")
154
+ #-------------- Text-----
155
+ title = 'Trampas Barceló'
156
+ description = """
157
+ <p>
158
+ <center>
159
+ Sistemas de Desarrollado por Subsecretaría de Modernización del Municipio de Vicente López. Advertencia solo usar fotos provenientes de las trampas Barceló, no de celular o foto de internet.
160
+ <img src="https://www.vicentelopez.gov.ar/assets/images/logo-mvl.png" alt="logo" width="250"/>
161
+ </center>
162
+ </p>
163
+ """
164
+ article ="<p style='text-align: center'><a href='https://docs.google.com/presentation/d/1T5CdcLSzgRe8cQpoi_sPB4U170551NGOrZNykcJD0xU/edit?usp=sharing' target='_blank'>Para mas info, clik para ir al white paper</a></p><p style='text-align: center'><a href='https://drive.google.com/drive/folders/1owACN3HGIMo4zm2GQ_jf-OhGNeBVRS7l?usp=sharing ' target='_blank'>Google Colab Demo</a></p><p style='text-align: center'><a href='https://github.com/Municipalidad-de-Vicente-Lopez/Trampa_Barcelo' target='_blank'>Repo Github</a></p></center></p>"
165
+
166
+ examples = [['640',0.45, 0.75,'ejemplo1.jpg'], ['640',0.45, 0.75,'ejemplo2.jpg']]
167
+
168
+ iface = gr.Interface(yolo,
169
+ inputs=[in1, in2, in3, in4],
170
+ outputs=[out2,out3,out4], title=title,
171
+ description=description,
172
+ article=article,
173
+ examples=examples,
174
+ analytics_enabled=False,
175
+ allow_flagging="manual",
176
+ flagging_options=["Correcto", "Incorrecto", "Casi correcto", "Error", "Otro"],
177
+ #flagging_callback=hf_writer
178
+ )
179
+
180
+ iface.launch(debug=True)
181
+
182
+ """For YOLOv5 PyTorch Hub inference with **PIL**, **OpenCV**, **Numpy** or **PyTorch** inputs please see the full [YOLOv5 PyTorch Hub Tutorial](https://github.com/ultralytics/yolov5/issues/36).
183
+ ## Citation
184
+ [![DOI](https://zenodo.org/badge/264818686.svg)](https://zenodo.org/badge/latestdoi/264818686)
185
+ """
requirements.txt ADDED
@@ -0,0 +1,32 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ # pip install -r requirements.txt
2
+ # base ----------------------------------------
3
+ ultralytics==8.1.0
4
+ ultralyticsplus==0.1.0
5
+ #gitpython>=3.1.30
6
+ gradio
7
+ IPython
8
+ matplotlib>=3.2.2
9
+ numpy>=1.18.5
10
+ opencv-python-headless
11
+ pillow
12
+ psutil
13
+ PyYAML>=5.3.1
14
+ scipy>=1.4.1
15
+ torch>=1.7.0
16
+ torchvision>=0.8.1
17
+ tqdm>=4.41.0
18
+ # logging -------------------------------------
19
+ tensorboard>=2.4.1
20
+ # wandb
21
+ # plotting ------------------------------------
22
+ seaborn>=0.11.0
23
+ pandas
24
+ # export --------------------------------------
25
+ # coremltools>=4.1
26
+ # onnx>=1.9.0
27
+ # scikit-learn==0.19.2 # for coreml quantization
28
+ # extras --------------------------------------
29
+ # Cython # for pycocotools https://github.com/cocodataset/cocoapi/issues/172
30
+ # pycocotools>=2.0 # COCO mAP
31
+ # albumentations>=1.0.3
32
+ thop # FLOPs computation