Spaces:
Build error
Build error
fcernafukuzaki
commited on
Upload 2 files
Browse files- app.py +185 -0
- requirements.txt +32 -0
app.py
ADDED
@@ -0,0 +1,185 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
# -*- coding: utf-8 -*-
|
2 |
+
"""Deploy Barcelo demo.ipynb
|
3 |
+
Automatically generated by Colaboratory.
|
4 |
+
Original file is located at
|
5 |
+
https://colab.research.google.com/drive/1FxaL8DcYgvjPrWfWruSA5hvk3J81zLY9
|
6 |
+
![ ](https://www.vicentelopez.gov.ar/assets/images/logo-mvl.png)
|
7 |
+
# Modelo
|
8 |
+
YOLO es una familia de modelos de detección de objetos a escala compuesta entrenados en COCO dataset, e incluye una funcionalidad simple para Test Time Augmentation (TTA), model ensembling, hyperparameter evolution, and export to ONNX, CoreML and TFLite.
|
9 |
+
## Gradio Inferencia
|
10 |
+
![](https://i.ibb.co/982NS6m/header.png)
|
11 |
+
Este Notebook se acelera opcionalmente con un entorno de ejecución de GPU
|
12 |
+
----------------------------------------------------------------------
|
13 |
+
YOLOv5 Gradio demo
|
14 |
+
*Author: Ultralytics LLC and Gradio*
|
15 |
+
# Código
|
16 |
+
"""
|
17 |
+
|
18 |
+
#!pip install -qr https://raw.githubusercontent.com/ultralytics/yolov5/master/requirements.txt gradio # install dependencies
|
19 |
+
|
20 |
+
import os
|
21 |
+
import re
|
22 |
+
import json
|
23 |
+
import numpy as np
|
24 |
+
import pandas as pd
|
25 |
+
import gradio as gr
|
26 |
+
import torch
|
27 |
+
from PIL import Image
|
28 |
+
from ultralytics import YOLO
|
29 |
+
from ultralyticsplus import render_result
|
30 |
+
|
31 |
+
# Images
|
32 |
+
torch.hub.download_url_to_file('https://i.pinimg.com/originals/7f/5e/96/7f5e9657c08aae4bcd8bc8b0dcff720e.jpg', 'ejemplo1.jpg')
|
33 |
+
torch.hub.download_url_to_file('https://i.pinimg.com/originals/c2/ce/e0/c2cee05624d5477ffcf2d34ca77b47d1.jpg', 'ejemplo2.jpg')
|
34 |
+
|
35 |
+
# Model
|
36 |
+
class YOLODetect():
|
37 |
+
def __init__(self, modelo):
|
38 |
+
self.modelo = YOLO(modelo)
|
39 |
+
|
40 |
+
def predecir(self, url):
|
41 |
+
# conf float 0.25 umbral de confianza del objeto para la detección
|
42 |
+
# iou float 0.7 umbral de intersección sobre unión (IoU) para NMS
|
43 |
+
self.source = url
|
44 |
+
self.results = self.modelo.predict(source=self.source, imgsz=640, conf=0.5, iou=0.40)
|
45 |
+
return self.results
|
46 |
+
|
47 |
+
def show(self):
|
48 |
+
render = render_result(model=self.modelo, image=self.source, result=self.results[0])
|
49 |
+
return render
|
50 |
+
|
51 |
+
def to_json(self):
|
52 |
+
array_numpy = self.results[0].boxes.cls.cpu().numpy().astype(np.int32)
|
53 |
+
# Definir las clases y sus nombres correspondientes
|
54 |
+
clases = {
|
55 |
+
0: "Aedes",
|
56 |
+
1: "Mosquitos",
|
57 |
+
2: "Moscas"
|
58 |
+
}
|
59 |
+
|
60 |
+
# Contabilizar las clases
|
61 |
+
conteo_clases = np.bincount(array_numpy)
|
62 |
+
|
63 |
+
self.json_result = [{'Especie': clases[i], 'Cantidad': conteo_clases[i] if i < len(conteo_clases) else 0} for i in range(len(clases))]
|
64 |
+
return self.json_result
|
65 |
+
|
66 |
+
def to_dataframe(self):
|
67 |
+
return pd.DataFrame(self.json_result)
|
68 |
+
|
69 |
+
modelo_yolo = YOLO('best.pt')
|
70 |
+
#HF_TOKEN = os.getenv("ZIKA_TOKEN_WRITE")
|
71 |
+
#hf_writer = gr.HuggingFaceDatasetSaver(HF_TOKEN, "demo-iazika-flags")
|
72 |
+
|
73 |
+
# def getQuantity(string):
|
74 |
+
# contador_raw = ''.join(string.split(" ")[3:])
|
75 |
+
|
76 |
+
# resultado_especie_1 = 'Aedes'
|
77 |
+
# resultado_especie_2 = 'Mosquito'
|
78 |
+
# resultado_especie_3 = 'Mosca'
|
79 |
+
# resultado_cantidad_1 = ''.join(re.findall(r'\d+',''.join(re.findall(r'\d+'+resultado_especie_1, contador_raw))))
|
80 |
+
# resultado_cantidad_2 = ''.join(re.findall(r'\d+',''.join(re.findall(r'\d+'+resultado_especie_2, contador_raw))))
|
81 |
+
# resultado_cantidad_3 = ''.join(re.findall(r'\d+',''.join(re.findall(r'\d+'+resultado_especie_3, contador_raw))))
|
82 |
+
# resultado_cantidad_1 = resultado_cantidad_1 if len(resultado_cantidad_1) > 0 else "0"
|
83 |
+
# resultado_cantidad_2 = resultado_cantidad_2 if len(resultado_cantidad_2) > 0 else "0"
|
84 |
+
# resultado_cantidad_3 = resultado_cantidad_3 if len(resultado_cantidad_3) > 0 else "0"
|
85 |
+
|
86 |
+
# resultado_lista = [[resultado_cantidad_1,resultado_especie_1],
|
87 |
+
# [resultado_cantidad_2,resultado_especie_2],
|
88 |
+
# [resultado_cantidad_3,resultado_especie_3]]
|
89 |
+
|
90 |
+
# return resultado_lista
|
91 |
+
|
92 |
+
# def listJSON(resultado):
|
93 |
+
# resultado_lista = getQuantity(resultado)
|
94 |
+
# img_name = " ".join(resultado.split(" ")[0:2])
|
95 |
+
# img_size = "".join(resultado.split(" ")[2])
|
96 |
+
# strlista = ""
|
97 |
+
# for resultado_lista, description in resultado_lista:
|
98 |
+
# strlista += '{"quantity":"'+resultado_lista+'","description":"'+description+'"},'
|
99 |
+
# strlista = strlista[:-1]
|
100 |
+
# str_resultado_lista = '{"image":"'+str(img_name)+'","size":"'+str(img_size)+'","detail":['+strlista+']}'
|
101 |
+
# json_string = json.loads(str_resultado_lista)
|
102 |
+
# return json_string
|
103 |
+
|
104 |
+
# def arrayLista(resultado):
|
105 |
+
# resultado_lista = getQuantity(resultado)
|
106 |
+
# df = pd.DataFrame(resultado_lista,columns=['Cantidad','Especie'])
|
107 |
+
# return df
|
108 |
+
|
109 |
+
def yolo(size, iou, conf, im):
|
110 |
+
'''Wrapper fn for gradio'''
|
111 |
+
g = (int(size) / max(im.size)) # gain
|
112 |
+
im = im.resize((int(x * g) for x in im.size), Image.LANCZOS) # resize with antialiasing
|
113 |
+
|
114 |
+
|
115 |
+
# model.iou = iou
|
116 |
+
|
117 |
+
# model.conf = conf
|
118 |
+
|
119 |
+
|
120 |
+
# results2 = model(im) # inference
|
121 |
+
# #print(type(results2))
|
122 |
+
|
123 |
+
source = Image.open(im)
|
124 |
+
model = YOLODetect(modelo_yolo)
|
125 |
+
# perform inference
|
126 |
+
results = model.predecir(source)
|
127 |
+
|
128 |
+
result_json = model.to_json()
|
129 |
+
print(result_json)
|
130 |
+
result_df = model.to_dataframe()
|
131 |
+
print(result_df)
|
132 |
+
result_img = model.show()
|
133 |
+
|
134 |
+
# results2.render() # updates results.imgs with boxes and labels
|
135 |
+
|
136 |
+
# results_detail = str(results2)
|
137 |
+
# lista = listJSON(results_detail)
|
138 |
+
# lista2 = arrayLista(results_detail)
|
139 |
+
# return Image.fromarray(results2.ims[0]), lista2, lista
|
140 |
+
return result_img, result_df, result_json
|
141 |
+
|
142 |
+
#------------ Interface-------------
|
143 |
+
|
144 |
+
|
145 |
+
|
146 |
+
in1 = gr.Radio(['640', '1280'], label="Tamaño de la imagen", type='value')
|
147 |
+
in2 = gr.Slider(minimum=0, maximum=1, step=0.05, label='NMS IoU threshold')
|
148 |
+
in3 = gr.Slider(minimum=0, maximum=1, step=0.05, label='Umbral o threshold')
|
149 |
+
in4 = gr.Image(type='pil', label="Original Image")
|
150 |
+
|
151 |
+
out2 = gr.Image(type="pil", label="YOLOv5")
|
152 |
+
out3 = gr.Dataframe(label="Cantidad_especie", headers=['Cantidad','Especie'], type="pandas")
|
153 |
+
out4 = gr.JSON(label="JSON")
|
154 |
+
#-------------- Text-----
|
155 |
+
title = 'Trampas Barceló'
|
156 |
+
description = """
|
157 |
+
<p>
|
158 |
+
<center>
|
159 |
+
Sistemas de Desarrollado por Subsecretaría de Modernización del Municipio de Vicente López. Advertencia solo usar fotos provenientes de las trampas Barceló, no de celular o foto de internet.
|
160 |
+
<img src="https://www.vicentelopez.gov.ar/assets/images/logo-mvl.png" alt="logo" width="250"/>
|
161 |
+
</center>
|
162 |
+
</p>
|
163 |
+
"""
|
164 |
+
article ="<p style='text-align: center'><a href='https://docs.google.com/presentation/d/1T5CdcLSzgRe8cQpoi_sPB4U170551NGOrZNykcJD0xU/edit?usp=sharing' target='_blank'>Para mas info, clik para ir al white paper</a></p><p style='text-align: center'><a href='https://drive.google.com/drive/folders/1owACN3HGIMo4zm2GQ_jf-OhGNeBVRS7l?usp=sharing ' target='_blank'>Google Colab Demo</a></p><p style='text-align: center'><a href='https://github.com/Municipalidad-de-Vicente-Lopez/Trampa_Barcelo' target='_blank'>Repo Github</a></p></center></p>"
|
165 |
+
|
166 |
+
examples = [['640',0.45, 0.75,'ejemplo1.jpg'], ['640',0.45, 0.75,'ejemplo2.jpg']]
|
167 |
+
|
168 |
+
iface = gr.Interface(yolo,
|
169 |
+
inputs=[in1, in2, in3, in4],
|
170 |
+
outputs=[out2,out3,out4], title=title,
|
171 |
+
description=description,
|
172 |
+
article=article,
|
173 |
+
examples=examples,
|
174 |
+
analytics_enabled=False,
|
175 |
+
allow_flagging="manual",
|
176 |
+
flagging_options=["Correcto", "Incorrecto", "Casi correcto", "Error", "Otro"],
|
177 |
+
#flagging_callback=hf_writer
|
178 |
+
)
|
179 |
+
|
180 |
+
iface.launch(debug=True)
|
181 |
+
|
182 |
+
"""For YOLOv5 PyTorch Hub inference with **PIL**, **OpenCV**, **Numpy** or **PyTorch** inputs please see the full [YOLOv5 PyTorch Hub Tutorial](https://github.com/ultralytics/yolov5/issues/36).
|
183 |
+
## Citation
|
184 |
+
[![DOI](https://zenodo.org/badge/264818686.svg)](https://zenodo.org/badge/latestdoi/264818686)
|
185 |
+
"""
|
requirements.txt
ADDED
@@ -0,0 +1,32 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
# pip install -r requirements.txt
|
2 |
+
# base ----------------------------------------
|
3 |
+
ultralytics==8.1.0
|
4 |
+
ultralyticsplus==0.1.0
|
5 |
+
#gitpython>=3.1.30
|
6 |
+
gradio
|
7 |
+
IPython
|
8 |
+
matplotlib>=3.2.2
|
9 |
+
numpy>=1.18.5
|
10 |
+
opencv-python-headless
|
11 |
+
pillow
|
12 |
+
psutil
|
13 |
+
PyYAML>=5.3.1
|
14 |
+
scipy>=1.4.1
|
15 |
+
torch>=1.7.0
|
16 |
+
torchvision>=0.8.1
|
17 |
+
tqdm>=4.41.0
|
18 |
+
# logging -------------------------------------
|
19 |
+
tensorboard>=2.4.1
|
20 |
+
# wandb
|
21 |
+
# plotting ------------------------------------
|
22 |
+
seaborn>=0.11.0
|
23 |
+
pandas
|
24 |
+
# export --------------------------------------
|
25 |
+
# coremltools>=4.1
|
26 |
+
# onnx>=1.9.0
|
27 |
+
# scikit-learn==0.19.2 # for coreml quantization
|
28 |
+
# extras --------------------------------------
|
29 |
+
# Cython # for pycocotools https://github.com/cocodataset/cocoapi/issues/172
|
30 |
+
# pycocotools>=2.0 # COCO mAP
|
31 |
+
# albumentations>=1.0.3
|
32 |
+
thop # FLOPs computation
|