Update app.py
Browse files
app.py
CHANGED
@@ -10,29 +10,25 @@ from matplotlib.legend import Legend
|
|
10 |
model = YOLO("model.pt")
|
11 |
|
12 |
def process_image(image):
|
13 |
-
# Convertir la imagen de PIL a NumPy array y de RGB a BGR
|
14 |
-
|
15 |
-
|
16 |
|
17 |
-
# Realizar inferencia en la imagen
|
18 |
-
results = model.predict(source=
|
19 |
-
|
20 |
-
# Crear una carpeta para guardar las imágenes individuales (opcional)
|
21 |
-
# output_folder = "mascaras_individuales"
|
22 |
-
# os.makedirs(output_folder, exist_ok=True)
|
23 |
|
24 |
# Inicializar la lista para almacenar la información de las máscaras
|
25 |
mask_info_list = []
|
26 |
|
27 |
-
# Crear una imagen en blanco para las máscaras
|
28 |
-
mask_image = np.zeros_like(
|
29 |
|
30 |
# Procesar resultados
|
31 |
for result in results:
|
32 |
# Verificar si se detectaron máscaras
|
33 |
if result.masks is not None and len(result.masks.data) > 0:
|
34 |
# Obtener las máscaras, las probabilidades y las clases
|
35 |
-
masks = result.masks.data.cpu().numpy() #
|
36 |
confidences = result.boxes.conf.cpu().numpy() # Probabilidades
|
37 |
classes = result.boxes.cls.cpu().numpy().astype(int)
|
38 |
names = model.names # Nombres de las clases
|
@@ -43,9 +39,9 @@ def process_image(image):
|
|
43 |
# Redimensionar las máscaras para que coincidan con el tamaño de la imagen
|
44 |
resized_masks = []
|
45 |
for mask in masks:
|
46 |
-
mask_resized = cv2.resize(mask, (
|
47 |
resized_masks.append(mask_resized)
|
48 |
-
resized_masks = np.array(resized_masks) #
|
49 |
|
50 |
# Aplicar suavizado a las máscaras
|
51 |
smoothed_masks = []
|
@@ -66,11 +62,11 @@ def process_image(image):
|
|
66 |
sorted_confidences_norm = confidences_norm[sorted_indices]
|
67 |
sorted_classes = classes[sorted_indices]
|
68 |
|
69 |
-
# Definir el mapa de colores
|
70 |
-
colormap = plt.cm.get_cmap('viridis')
|
71 |
|
72 |
# Crear una matriz para rastrear qué máscara se asigna a cada píxel
|
73 |
-
mask_indices = np.full((
|
74 |
|
75 |
# Procesar cada máscara y asignar máscaras de mayor probabilidad a los píxeles
|
76 |
for idx_in_order, (idx, mask, conf_norm, conf, cls) in enumerate(
|
@@ -83,45 +79,34 @@ def process_image(image):
|
|
83 |
mask_indices[update_mask] = idx
|
84 |
|
85 |
# Obtener el color del mapa de colores basado en la probabilidad normalizada
|
86 |
-
color_rgb = colormap(conf_norm)[:3]
|
87 |
-
|
88 |
-
|
89 |
|
90 |
# Almacenar la información de la máscara
|
91 |
mask_info = {
|
92 |
'mask_index': idx,
|
93 |
'class': names[cls],
|
94 |
'confidence': conf,
|
95 |
-
'color_rgb':
|
96 |
-
'color_bgr':
|
97 |
}
|
98 |
mask_info_list.append(mask_info)
|
99 |
|
100 |
# Asignar colores a los píxeles correspondientes en la imagen de máscaras
|
101 |
for i in range(3):
|
102 |
-
mask_image[:, :, i][update_mask] =
|
103 |
-
|
104 |
-
# Generar y guardar la imagen individual de la máscara (opcional)
|
105 |
-
# mask_rgb = np.zeros_like(img, dtype=np.float32)
|
106 |
-
# for i in range(3):
|
107 |
-
# mask_rgb[:, :, i] = mask * color_bgr[i] # Usar la máscara suavizada
|
108 |
-
# img_individual = cv2.addWeighted(img.astype(np.float32), 1, mask_rgb, 0.2, 0).astype(np.uint8)
|
109 |
-
# text_str = f"Stenosis probability: {conf:.2f}"
|
110 |
-
# cv2.putText(img_individual, text_str, (10, 30), cv2.FONT_HERSHEY_SIMPLEX, 1, color_bgr, 2)
|
111 |
-
# output_path = os.path.join(output_folder, f"imagen_mascara_{idx}.jpg")
|
112 |
-
# cv2.imwrite(output_path, img_individual)
|
113 |
|
114 |
# Superponer la imagen de máscaras sobre la imagen original
|
115 |
alpha = 0.2 # Transparencia ajustada
|
116 |
-
img_with_masks = cv2.addWeighted(
|
117 |
|
118 |
else:
|
119 |
# Si no hay máscaras, usar la imagen original
|
120 |
-
img_with_masks =
|
121 |
print("No se detectaron máscaras en esta imagen.")
|
122 |
|
123 |
-
# Convertir
|
124 |
-
img_rgb = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2RGB)
|
125 |
img_with_masks_rgb = cv2.cvtColor(img_with_masks, cv2.COLOR_BGR2RGB)
|
126 |
|
127 |
# Crear una figura para mostrar la imagen y la leyenda
|
@@ -134,9 +119,8 @@ def process_image(image):
|
|
134 |
handles = []
|
135 |
labels = []
|
136 |
for mask_info in mask_info_list:
|
137 |
-
|
138 |
-
|
139 |
-
patch = Rectangle((0, 0), 1, 1, facecolor=color_normalized)
|
140 |
label = f"Stenosis probability: {mask_info['confidence']:.2f}"
|
141 |
handles.append(patch)
|
142 |
labels.append(label)
|
|
|
10 |
model = YOLO("model.pt")
|
11 |
|
12 |
def process_image(image):
|
13 |
+
# Convertir la imagen de PIL a NumPy array y de RGB a BGR (PIL usa RGB, OpenCV usa BGR)
|
14 |
+
img_rgb = np.array(image)
|
15 |
+
img_bgr = cv2.cvtColor(img_rgb, cv2.COLOR_RGB2BGR)
|
16 |
|
17 |
+
# Realizar inferencia en la imagen BGR
|
18 |
+
results = model.predict(source=img_bgr, save=False)
|
|
|
|
|
|
|
|
|
19 |
|
20 |
# Inicializar la lista para almacenar la información de las máscaras
|
21 |
mask_info_list = []
|
22 |
|
23 |
+
# Crear una imagen en blanco para las máscaras (en formato BGR)
|
24 |
+
mask_image = np.zeros_like(img_bgr, dtype=np.uint8)
|
25 |
|
26 |
# Procesar resultados
|
27 |
for result in results:
|
28 |
# Verificar si se detectaron máscaras
|
29 |
if result.masks is not None and len(result.masks.data) > 0:
|
30 |
# Obtener las máscaras, las probabilidades y las clases
|
31 |
+
masks = result.masks.data.cpu().numpy() # Shape: (num_masks, height, width)
|
32 |
confidences = result.boxes.conf.cpu().numpy() # Probabilidades
|
33 |
classes = result.boxes.cls.cpu().numpy().astype(int)
|
34 |
names = model.names # Nombres de las clases
|
|
|
39 |
# Redimensionar las máscaras para que coincidan con el tamaño de la imagen
|
40 |
resized_masks = []
|
41 |
for mask in masks:
|
42 |
+
mask_resized = cv2.resize(mask, (img_bgr.shape[1], img_bgr.shape[0]), interpolation=cv2.INTER_LINEAR)
|
43 |
resized_masks.append(mask_resized)
|
44 |
+
resized_masks = np.array(resized_masks) # Shape: (num_masks, height, width)
|
45 |
|
46 |
# Aplicar suavizado a las máscaras
|
47 |
smoothed_masks = []
|
|
|
62 |
sorted_confidences_norm = confidences_norm[sorted_indices]
|
63 |
sorted_classes = classes[sorted_indices]
|
64 |
|
65 |
+
# Definir el mapa de colores (puedes cambiar a 'plasma', 'inferno', etc.)
|
66 |
+
colormap = plt.cm.get_cmap('viridis') # Cambia 'viridis' por 'plasma' o 'inferno' si lo deseas
|
67 |
|
68 |
# Crear una matriz para rastrear qué máscara se asigna a cada píxel
|
69 |
+
mask_indices = np.full((img_bgr.shape[0], img_bgr.shape[1]), -1, dtype=int)
|
70 |
|
71 |
# Procesar cada máscara y asignar máscaras de mayor probabilidad a los píxeles
|
72 |
for idx_in_order, (idx, mask, conf_norm, conf, cls) in enumerate(
|
|
|
79 |
mask_indices[update_mask] = idx
|
80 |
|
81 |
# Obtener el color del mapa de colores basado en la probabilidad normalizada
|
82 |
+
color_rgb = colormap(conf_norm)[:3] # Color en formato RGB [0, 1]
|
83 |
+
color_rgb_255 = [int(c * 255) for c in color_rgb] # Escalar a [0, 255]
|
84 |
+
color_bgr_255 = color_rgb_255[::-1] # Convertir de RGB a BGR
|
85 |
|
86 |
# Almacenar la información de la máscara
|
87 |
mask_info = {
|
88 |
'mask_index': idx,
|
89 |
'class': names[cls],
|
90 |
'confidence': conf,
|
91 |
+
'color_rgb': color_rgb_255,
|
92 |
+
'color_bgr': color_bgr_255
|
93 |
}
|
94 |
mask_info_list.append(mask_info)
|
95 |
|
96 |
# Asignar colores a los píxeles correspondientes en la imagen de máscaras
|
97 |
for i in range(3):
|
98 |
+
mask_image[:, :, i][update_mask] = color_bgr_255[i]
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
99 |
|
100 |
# Superponer la imagen de máscaras sobre la imagen original
|
101 |
alpha = 0.2 # Transparencia ajustada
|
102 |
+
img_with_masks = cv2.addWeighted(img_bgr.astype(np.float32), 1, mask_image.astype(np.float32), alpha, 0).astype(np.uint8)
|
103 |
|
104 |
else:
|
105 |
# Si no hay máscaras, usar la imagen original
|
106 |
+
img_with_masks = img_bgr.copy()
|
107 |
print("No se detectaron máscaras en esta imagen.")
|
108 |
|
109 |
+
# Convertir la imagen de BGR a RGB para matplotlib
|
|
|
110 |
img_with_masks_rgb = cv2.cvtColor(img_with_masks, cv2.COLOR_BGR2RGB)
|
111 |
|
112 |
# Crear una figura para mostrar la imagen y la leyenda
|
|
|
119 |
handles = []
|
120 |
labels = []
|
121 |
for mask_info in mask_info_list:
|
122 |
+
color_rgb_normalized = np.array(mask_info['color_rgb']) / 255 # Normalizar al rango [0, 1]
|
123 |
+
patch = Rectangle((0, 0), 1, 1, facecolor=color_rgb_normalized)
|
|
|
124 |
label = f"Stenosis probability: {mask_info['confidence']:.2f}"
|
125 |
handles.append(patch)
|
126 |
labels.append(label)
|